店舗併用住宅の申請が可能か知りたい。

住宅部分を対象として申請可能です。
ただし、設計住宅性能評価では「共同住宅等」、BELS評価では「複合建築物」の「住戸（店舗等併用住宅の住戸部分）」として評価します。
商品に応じて用途名が異なりますので申請の際にはご注意ください。